| Protein ZmMYBR7 | |
|---|---|
|
ZmMYBR7 is a protein in the MYB-related family.
|
|
| Information | |
| TF Name: | ZmMYBR7 |
| Species: | Maize |
| TF Family: | MYB-related |
| Gene Name(Synonym): | SMH4 |
| Uniprot ID: | Q8W119 |
Protein ZmMYBR7
ZmMYBR7 is a protein in the MYB-related family.
| Overview of domains present in v5 transcripts | |||
|---|---|---|---|
| PF00249 | PF00538 | PF13921 | |
| Zm00001eb155280_T001 |  | | |
Protein-DNA Interactions
Meme Logos for Maize v4 Gene IDs
| Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
|---|---|---|---|---|---|
| Zm00001d043696 | DAPseq |  |
sequence | fimo | position |
| Zm00001d043696 | DAPseq |  |
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| Zm00001d043696 | ChIPseq |  |
sequence | fimo | position |
| Zm00001d043696 | PChIPseq |  |
sequence | fimo | position |
Interactions where ZmMYBR7 is the regulator
Interactions where ZmMYBR7 is the target
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Zm00001eb155280_T001 from maize genome v5
Amino Acid Sequence
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| Secondary Structure Color Code | |
|---|---|
| BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
| HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
| HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
| HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
| HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
| STRN | beta strand |
| TURN_TY1_P | type I turn |
| UNDETERMINED | no data available |
| Domains Present | |
|---|---|
| PF00249 |
|
| PF13921 |
|
| PF00538 |
|
| PF00538 |
|
| PF00538 |
|
| Hover here to show all domains | |
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GRMZM2G108424_T02 from maize genome v3
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TTTCTACCACGAGCACTATTACTTTTATTTAAAATTATAATAAACCACGATTGTATCTATAGTTAGATCATAATCTAATGGATCAGGTAATTCGCTTGCGCCGTTGGATACAGATACTTCTTTCGTAACAGTCGTTCTCTTTTTCTACAACTCTACTGAAGACATGGGTTAGGGTTTCCGCGTCGGCTAGTTTGGACGCATGGCTGCTGCAGGAGAGTAGAGACCACAGCGCGCGAGGCGAGGAGAATAAGCTATGGGCGCGCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAAGAGGAGGATGCGCTCCGCGCCGGCGTGCGCAAGCACGGCGCCGGCAAATGGCGGACCATCCAGAAGGACCCCGAGTTCAGCCCGGTCCTCTCCTCCCGCTCCAACATCGACCTCAAGGACAAATGGAGGAATTTAAGTTTCAGTGCAAGTGGACTGGGATCAAGTAAACTGCGGGTTCCAAAGATAACTGGACCCTCATCTTCCCCATCATCTAGCTCGCAGCCTCTGCTTCTCCCAGCGGCAAACAAATTTACTGAAGCTACACTGCCTGCAGATGCTGAGAAAAAGCCACAGGATGGGAAAACTCTGCCAAAGTATGGTGCCATGATCATGGAAGCTCTTTTGGAATTGAATGAGCCGAATGGTTCAGATATTGCTGCAATCTTCGGCTTCATAGAGCAAAGGTATGCGGTACAACCGACCTTCAGAAGATTTCTAGCCTCAAAGTTACGGCGACTTGCAGACTCAAACAAAATTGAAAAGATCGATAAGTCCTATAGGCTCCCAGACTCCCTTGCAACAAGGACTCCAGCTCCAATGAATGCTTCAGCTCCAAAACAGAAGGATCCATCAAAGCCATCGAAGGTGTCAAAGGCCATAGGATTGTTTTCTGCCTCCAGCCCTGCACTAGAGGCTGCGATGGCAGCTGCTGTCAAGGTGGCTGACGCGGAGGCAAAAGCACATGATGCGCATGATCAGACGATGGAGGCAGAAAGGATCTTCAAGATGGCCGAGGATACCGAGTCTCTCCTCATAATTGCAGCAGAGATCTATGATCGATGTTCAAGGGGAGAGATAACCACGTTAGTTCCAGTGGCACAAAGGGAGATTTGAGATCTATTGGAGTCTCTCTTGTGTTGTTTGTTGTACATGGATAGGTTCTGGAATCCAGTGGCCCGGATTGCTCCTGTTGTATGATGTAACCGTTTGTGTTATACTGTCTCCGTTCTTCGATATTTATCGTATCCTAGTTCATTTTTAAAATAAAATGCGACAAATAAAAAAGAACGGAGTGAGTACTTAGGATGTGCCCTAGGGTTAACAAAATAACATCAGCGCACCGCCTGCCTTCAAACTTCTGTAATATGTAACCCCGTCTTTCCCAGCCTGTCACTGCAAGCTGCGATCGTGTATCCTGATGTCAGTATTGTATTTTTTTTTTCCTTGGCATGATGAGAGAATAGGGAAGTGTTCTAAACAAATGAAGTAGGGTAGGAAGGTGAAGTGTTCTTGGTATGCGATAACAATAATCTGTGCCGCACTTTCAATTTGAGAATGTTGTGTTAGACCCT
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Zm00001d043696_T004 from maize genome v4
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TGGGTTAGGGTTTCCGCGTCGGCTAGTTTGGACGCATGGCTGCTGCAGGAGAGTAGAGACCACAGCGCGCGAGGCGAGGAGAATAAGCTATGGGCGCGCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAAGAGGAGGATGCGCTCCGCGCCGGCGTGCGCAAGCACGGCGCCGGCAAATGGCGGACCATCCAGAAGGACCCCGAGTTCAGCCCGGTCCTCTCCTCCCGCTCCAACATCGACCTCAAGGACAAATGGAGGAATTTAAGTTTCAGTGCAAGTGGACTGGGATCAAGTAAACTGCGGGTTCCAAAGATAACTGGACCCTCATCTTCCCCATCATCTAGCTCGCAGCCTCTGCTTCTCCCAGCGGCAAACAAATTTACTGAAGCTACACTGCCTGCAGATGCTGAGAAAAAGCCACAGGATGGGAAAACTCTGCCAAAGTATGGTGCCATGATCATGGAAGCTCTTTTGGAATTGAATGAGCCGAATGGTTCAGATATTGCTGCAATCTTCGGCTTCATAGAGCAAAGGTATGCGGTACAACCGACCTTCAGAAGATTTCTAGCCTCAAAGTTACGGCGACTTGCAGACTCAAACAAAATTGAAAAGATCGATAAGTCCTATAGGCTCCCAGACTCCCTTGCAACAAGGACTCCAGCTCCAATGAATGCTTCAGCTCCAAAACAGAAGGATCCATCAAAGCCATCGAAGGTGTCAAAGGCCATAGGATTGTTTTCTGCCTCCAGCCCTGCACTAGAGGCTGCGATGGCAGCTGCTGTCAAGGTGGCTGACGCGGAGGCAAAAGCACATGATGCGCATGATCAGACGATGGAGGCAGAAAGGATCTTCAAGATGGCCGAGGATACCGAGTCTCTCCTCATAATTGCAGCAGAGATCTATGATCGATGTTCAAGGGGAGAGATAACCACGTTAGTTCCAGTGGCACAAAGGGAGATTTGAGATCTATTGGAGTCTCTCTTGTGTTGTTTGTTGTACATGGATAGGTTCTGGAATCCAGTGGCCCGGATTGCTCCTGGGTTAACAAAATAACATCAGCGCACCGCCTGCCTTCAAACTTCTGTAATATGTAA
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Zm00001d043696_T006 from maize genome v4
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WRKASIRIPKSKRKGFNSVVILGAWRLWKQRNRCVFMELGPAFLP
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GCGTCGGCTAGTTTGGACGCATGGCTGCTGCAGGAGAGTAGAGACCACAGCGCGCGAGGCGAGGAGAATAAGCTATGGGCGCGCCGAAGCAGAAATGGACGTCGGAAGAGGAGGATGCGCTCCGCGCCGGCGTGCGCAAGCACGGCGCCGGCAAATGGCGGACCATCCAGAAGGACCCCGAGTTCAGCCCGGTCCTCTCCTCCCGCTCCAACATCGACCTCAAGGTATCTTCCCCTGCATCTTCCCCGCCGCTCTCCATCTACCTGGCCGCGACGGAACTAGCCGTGCGCCGTGCGCGTCCCTATGGGCCTGTTTGGTTGTGGAGCAAAGAAGCCTGACCAAAATTAGGTAAGTGACCAAAGCTAGGCTACCAACCAGAATTTGGCAAATGTCGTGATGTTTCGTACCGTCGTGTGCTTCTGAGCGTGTGGTGATTATTCCCTGCATAGCTCTCTCTCTCTCTATTAGTTGTGCGGTGCAGTTTCGTCGGTAGTACGGTAGTAGATTTGGGTCGTCGAAGGCGAGATTTTGGGTTTTGGGGAACTGATAATAAATGTAGGTGAAGGTTGAAATGGTCGTGTTCTGCTGCTGAGGGATGCTGTGATGTGATATTTTGCTCAAGGACAATGATGCTGTGGTGGTCATGGACACCGTTGTGAGATTACACATGGCAGTGTGAATGTTTTATGATCTGGGCTGTATGGTGTGCTTAAGTTGTTTTCATACTTGTGAACAATTGATTATTGAATTCAGTAGTGTTGCTGATCACATGTTAAACAGTTTTTCTGAAGAAGCAAATCACAGACAGATTACTTTTGATGTCCTCTTGCCCATGGATGTTGCCCTTGTGCCATTGATTATCAGGAATTTACTTTAACGGATGGGACTCATTTCCTTGTTTCTTAACATTGTTTTGATTGGTTTGAGTTCCTGATCATGTGATGATGATTCATGAGTAGGTGATTTCTTAAATCACATTCTTTTTGTTTGATGACAAATGCAAGCATGCCAGTGGAGAGACACTCTAGTCAGTGACTCAACATGCTCAGCTGTTATTGCTGTTGGGCTAGGATTCAGTGTGATAAATTTGATGGATATCCTGGTAATGCTACCATATTGTACACTCAAGAAGTTGCTTAGGGTTTTCAACCTTAGCAATTAAGGGCCATAATATTTTAATGAAATCTGCAAAAACATTCCTTCTCTGCTGTCCCCTCTGATTCCAAATTAAGTCATTTTATGATCCTAGCTGGTCAAACTTCTTTGACTTGACCTATCAAATATCAATATATGAAAATTGGCATAAATTCATAACACATGGTTGATGTTACTAGAAGGATAGGCCTGACGCAGTGGTGAGAAGCCTTTCCACTGAGCAAAAAGGTCATGGGTTCGACGTGGCCTCTCTACAAAATGCAGGGATAAGGCTTGCCTTGGTTATTTCTTCCCTAGACCCAACACATGTGGGAGCCACCAGCACTAGGTCTGTCCTTTTTTATTTCAAGTTGTATGCTTCTACAATAAAAGCTGCAAGTCAAATTTTCATATCAGAGACAGTATCACAATCCTAAGCAACTTAAGTTTGGAATCAGATGGAGCGAATGGCCTTCATGTTACCCTCTATCTCCATTGAACCAATGGTGTTGCAACATATTTTAAGAAACATAAGGAACACATCAATCTTCCTGACTAATTGCTTGTGTGCATCCTGCTTGTATAGGTATTGGCAATTGCTATCACACATCTGTTCACCTTGACCCTCAAGTACTCGGGCGGCATTACCGAGTAGTGCAAGAGTACATCTATTTTAGCAAAAAACATCAAATAAGTGTTGCAACACCTTTCCTTCAAGACATGAATTGTTAGTTTGTTACATGTGTCTATATAGACCATGAAACTATTGTGAGACAACATATATGAATTTACTTGTCTCCTGGAATAAACGGAAGTGGTAACCAGGAATGAGCTTGAAACCGAGGGAAAGAAGGCAGGAGTCCCCTGTGTTCCCCACCTAAATTTCTGTCTGAGCTCCGCTGCTGCTAGTGAGGAGCTCACTAAGAGCCAAGGATCCAACTGAGTACCAAAGGCCACACTCATGTGCCACCATTTGCTGTACTACCTGAACATTTGGTCTGACCTTTTCAAACACAAGAATTTCTTTGTTTCCAAATTTCTCAGACTACCAAAATGATAAAAAAAATGAAAGTTTCAAACCCTTCCTCAAATCCTTGGGAACATCTTTTATAGCATTGTATCACCACCTGGAGAAATGAGACAGAAGGTTAAGGGTAATAGGAAGCAGCCCCATGTGTTGGAGGATCATTGTCCAAACCTGTCTGGAGGACACACAGGAGATGAGGATGTGCTGAATTGTCTCATCAGCCTGTTCACATAAAGAGACACAGCAAATCCAGTATTTATTTTCTTGTAGCAACATGTTTGCACTATGTTGGATTTGGAAAGATAACTTTTCTCACCCTTCGTTTTTACCTTTCCCTGAGTCGATAACTGGAGCAAAGGCATAGCATGTTTTGCAAGTGATTAATAACTATCCCACTGACCACTGGTTTGAGAATATGCTTGTAACTATCCCATTGTTTTGATACTATCTTTGGCTTTTGATACTATCCCATTGTCTGCAAATGCGATGGCTTTGGCTTCAAAAAACTGCTCCTTCCAAGCCATGGAGTGGCCTTGATCTTAAAATCTCGTCCCACGCCAGAGCTTTATTTCAGGTTGCAGTGTCTACCACCATTGGTAATGGTACTTCAACCTTCTTTTGGAAAGATAAGTGGATTCATGGGTGTTCCATTGTGGATTTAGCTCCCCTCATTGCTGCTGCAGTTCCAAAGAAGATTAGAGAAGTAAGGACTGTGCAGCTGGCCCTTACCTCATATTATTGGGTTCATGATATCCAGAGAAATCTCTCCCTGGCTGCTATTGAGCAATACCTACAGCTATGGGAGGTTCTTGAAACTTTTCAGCTTCAAAATTCAAATGATAAACATGTGTGGTTATTTAGTAGTAATGGTTTATACACCTCCAAATCTGTCTACAGAGCTTTCTACATTGGAGCGGAATCCTTTGAGCCCTGGAAAAGAATTTGGAAGAGCTGGGCAGCCCCTAAGTGTAAGGTCTTTGTTTGGCTTGCTATAAACAATAAATGTTGGACAACCGACAGACTCGAAAAAAGGGGTCTTGATTATCCTGAAAATTGTGTTCTATGCGATCAAGAAGATGAAACTGTGCAGCATATTCTATCAAATTGCGTCTTCACAAGACAGTTTTGGCATAATATATTAACTCCAATTGGTCTCTCTTCTGTGGCTTCTAAGAGAAGAGATTCTTGTTTTGCTGAATGGTGGAGGAAGGCTTCAATTAGGATTCCTAAAAGCAAAAGAAAGGGCTTTAATAGTGTGGTCATCCTTGGGGCCTGGAGGCTTTGGAAACAGAGAAATAGGTGTGTTTTTATGGAGCTCGGCCCTGCCTTTCTACCTTAGAGGATGGTTTCAAAGATGAGATGTGGCCGTGGTTTTTTGCAGGAGCCAAGAACATGCGTTCTCTTTTTGATCCTGGTTAGAGGAAGGAAAGTCTTTTAGCCTCTTTGTAGGCTGGGGTGGTGGTGTTGTGTGTGGCTGGTATGTGTATGTGTTTGTGTGTGTGTTTGGTGTGTGTTTGTTGTGTGAGTCTGGTGCGTGTTTTTGTGTGTTGTGTCCTGTTTGTTCCAGGCCTCAGGCCTTTTTCCCTCTCCTTTAATATAATGATATGCATCCTGCGTATTCGAGAAAAAAGATACTATCTTGCCCAATTGATCAGCATGATTTGTCATGTAGCATGTTATGCTAAAGAAATATGCATGTCTGTTGTGGTTTCACTTTGAAGTGGATAAACATTGTAATTGTTCTTCATCCATACAATCCAATGTAAAAGGTGTGAAAAGTAAGACAGTTTGTTGTAGCAGCTCTATCATATGTAAAAGATGTGAAATGCGCGTCAATTCAGCTGTGCCAGTGAAGCTTGCACCATGGTCATAGGTTTTTCATTTTGGTCTTCTATGTGATATTCTATTTGGTATTTCCAGGACAAATGGAGGAATTTAAGTTTCAGTGCAAGTGGACTGGGATCAAGTAAACTGCGGGTTCCAAAGATAACTGGACCCTCATCTTCCCCATCATCTAGCTCGCAGCCTCTGCTTCTCCCAGCGGCAAACAAATTTACTGAAGCTACACTGCCTGCAGATGCTGAGAAAAAGCCACAGGATGGGAAAACTCTGCCAAAGTATGGTGCCATGATCATGGAAGCTCTTTTGGAATTGAATGAGCCGAATGGTTCAGATATTGCTGCAATCTTCGGCTTCATAGAGCAAAGGTATGCGGTACAACCGACCTTCAGAAGATTTCTAGCCTCAAAGTTACGGCGACTTGCAGACTCAAACAAAATTGAAAAGGCAAATCTCCCTTTTCTTAAATTAGACTACATTTATTTTTTCCCGTTCTTTTCATCTTAGTGAGACTTGTGTTTTCCCCTTCACAATCTGTTTGGATATGCAATCTATACTTTATCCCATGGATCTGGCATTCTACACATGTTCTGAACTAATCCAATCGAACCATCTGTGCTCCATTGGTCTCCTTGCTTGGTTGGCAAGGTATGCACTGCATTTCAGCGAAAGGGCCTCTAGCTAAGTTGTTTAGGTGGTCTGAGTAACAGTCCTGAGTTCGAATTCCAGTGGGAGCGAATTTGAGGCTGAGGTTAAAAAAGGTCACTCGCTAGTTCCCCTGGTTGTGTGCAGATGAGATGGACTGACCTAAGGGGGACAGATCCTTGTGTAGGGGCTGGGAGGGCTCAAAGCACGAGTAAAGATCCGGCCTATAGCGAATCCTTTTGTAGGGGCTGCGAATGCTAAAAGAAGATTAGCTGGGTTTGAATGTCGCTATCATGTATTCAGTCTGGTATCATTAAACAGAATATATCGGTAGTTAGTATTAATGCCATGCTTC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Zm00001d043696_T014 from maize genome v4
Amino Acid Sequence
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MGAPKQKWTSEEEDALRAGVRKHGAGKWRTIQKDPEFSPVLSSRSNIDLKDKWRNLSFSASGLGSSKLRVPKITGPSSSP
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